«Structures of the cyanobacterial nitrogen regulators NtcA and PipX complexed to
DNA shed light on DNA binding by NtcA and implicate PipX in the recruitment of RNA polymerase.»
Forcada-Nadal A, Bibak S, Salinas P, Contreras A, Rubio V, Llácer JL.
Nucleic Acids Res. 2025 Feb 8;53(4):gkaf096. doi: 10.1093/nar/gkaf096.
Roles of the PipX protein in the transcription of NtcA-regulated genes. NtcA in its 2-oxoglutarate (2OG)-activated conformation binds to its palindromic DNA box (called NtcA box) so that it can attract RNA polymerase and transcription is set on course. Binding of the small protein PipX to NtcA activated by 2OG binding enhances NtcA-dependent transcription by mechanisms detailed in the paper that do not involve interaction of PipX with DNA. Prominent among these is the interaction of PipX with components of RNA polymerase, revealed by this work.
Papeles de la proteína PipX en la transcripción de los genes regulados por NtcA. NtcA en su conformación activada por 2-oxoglutarato (2OG) se une a su caja palindrómica de DNA (llamada NtcA box) para que pueda atraerse a la RNA polimerasa y se ponga en marcha la transcripción. La unión de la pequeña proteína PipX a NtcA activado por la unión de 2OG aumenta la transcripción NtcA-dependiente por mecanismos que se detallan en el trabajo y que no incluyen la interacción de PipX con el DNA. Entre ellos destaca la interacción de PipX con componentes de la RNA polimerasa, puesta de manifiesto en este trabajo.
